上海儿童医学中心外科总床位数36张,据近7年(1998-2005)统计,总死亡率小于2%,由于近年来加强围手术期处理、监护设施齐全、麻醉、营养支持、外科手术操作技术进一步提高。使得<1岁新生儿婴儿外科死亡率<2。05%。据统计近7年来外地病人数比例占70%左右,病儿来源覆盖全国各地及港、澳地区,少部分国外求医者来自新加坡、日本、德国、韩国等国家,服务半径较大。相关学科支撑配套齐全,除了强力雄厚的211工程及上海市重点学科儿科外,其他如:影像学诊断、病理、实验室、化验、同位素、放射治疗、监护、功能康复等均具有国内先进水平。
医院占地面积100亩,总建筑面积约8.4万平方米,规模床位1000张,实际开放床位604张,重症监护床位数配置占总数的1/5。目前,年门急诊总量约140万人次,出院病人约2.2万人次,手术病人约1.3万人次,门急诊、日间手术0.7万人次。2010年,儿中心成为国内首家通过JCI国际医院认证的儿童专科医院。2012年,医院获得国家药物临床试验机构资格认定证书,共8个专业获得药物临床试验专业资格。
医院作为上海交通大学医学院的附属医院,儿科学专业已经成为国家重点学科、211工程、985工程、085工程重点建设学科,相关儿科亚专业相继获得国家临床重点专科、卫生部重点实验室、卫生部首批小儿先天性心脏病诊断和介入治疗继续教学的培训基地、上海市首批临床医学中心、上海市医学重点学科及上海市公共卫生重点学科等。医院还设有国内首家儿科转化医学研究所、上海市小儿先心病研究所,以及儿童听力、儿童血液肿瘤、注意力缺陷、呼吸循环、小儿肝病、儿童癫痫、儿童睡眠障碍等多个研究所及临床诊治中心。