医院学科门类齐全，设有业务科室47个，临床科室35个，辅诊科室12个，临床教研室20个，有博士授权学科28个，硕士授权学科33个，为临床博士后流动站。医院有10个国家重点学科，4个全军医学研究所，6个全军医学专科技术中心，2个上海市医学领先专业重点学科，2个上海市临床医学中心，是全军实验诊断重点实验室，国家药品临床研究基地，军队药品临床研究基地。

　　医院技术力量雄厚，现有高级职称专业技术人员244名，其中中国工程院院士1名，“国家千人计划”、“长江学者特聘教授”各1名，“国家杰青”3名，在职三级以上教授11名，享受国务院颁发的政府特殊津贴人员47名，6人被总政治部和国家人事部批准为有突出贡献的中青年专家。共40余人获得国家“百千万人才计划”、上海市“百人计划”、“曙光计划”、“科技启明星计划”、“领军人才”。10余人次评为上海市“十大科技精英”、“十大杰出青年”、“十佳医师”、“十佳护师”。7人为总后勤部科技银星、科技新星。11人荣获上海市青年医务人员最高荣誉奖“银蛇奖”。担任国际、国内学术组织重要职务505个。

　　医院具有骨科、神经外科、肾内科、泌尿外科、整形外科、急救科等六大传统优势学科，形成了器官移植、微创治疗、眼眶肿瘤治疗、肿瘤早期诊断与治疗、骨髓瘤及淋巴瘤诊断与治疗、睡眠障碍治疗、糖尿病及骨质疏松治疗、真菌病的诊断与治疗、外科伤病、颈动脉狭窄及大动脉瘤诊治等九大新兴医疗特色。疾病诊治方面的成就和经验获得数十项医疗成果奖，其中军队、上海市重大医疗成果奖30余项。“十一五”以来，先后承担国家、军队、地方大量科研攻关课题，三年获得国家科技进步二等奖2项、国家教育部全国高等院校优秀研究成果科学技术进步二等奖1项、中华医学科技一等奖1项、上海市科技进步一等奖3项、军队医疗成果一等奖2项、上海市医学科技一等奖2项、省部级二等奖11项，还获得了国家、军队、上海市教育研究成果奖5项；获得省部级以上科研项目408项，资助金额1.42亿元，其中国家自然科学基金158项；发表SCI收录论文558篇，其中10分以上6篇，2010年发表SCI收录论文193篇，全国医疗机构第13位，表现不俗论文排名第16位。

　　医院拥有38层现代化病房大楼，楼顶有可起降直升机的停机坪。有医疗仪器设备6500多台（件），其中核磁共振成像仪（MRI）、数字减影血管造影机（DSA）、64排多排螺旋CT、核素扫描仪、彩色多普勒超声仪、碎石机等大型医疗仪器100多台，总价值5亿多元。拥有国际先进的全净化手术室、层流病房和重症监护中心。医院有先进的网络信息系统和远程会诊中心，形成院前急救——院内急救——ICU病房的立体急救和战时急救体系，具有24小时救治大批量伤员能力。

　　全院人员始终履行“姓军为战、姓军为兵”历史使命，牢记“救死扶伤、服务军民”宗旨和“立德惟长、技卓以征”院训，大力弘扬“艰苦奋斗、爱民奉献、团结和谐、勇创一流”的“长征精神”。医院先后被评为全国“双拥模范单位”、“全国医院文化建设先进单位”、上海市卫生系统“医院文化建设十佳单位”；涌现出了“模范军医”吕士才、全国先进典型孔宪涛、肾内科血液透析中心、全国“三八红旗手”、全国“优秀青年卫士”、全国卫生系统“巾帼建功标兵”、全军“优秀共产党员”、总后“学习成才标兵”、上海“十大杰出青年”、“新长征突击手”等一批英模人物和先进集体。