上海市中医医院的前身为上海市立中医门诊部，始建于1954年，是新中国成立后第一批市级中医医疗机构。其后因历史原因几易其名，1979年正式改名为上海市中医医院。经过55年的发展壮大，上海市中医医院已发展成为一所中医特色浓厚、临床科室齐全、医学人才汇聚，集医、教、研为一体的三级甲等综合性中医医院，是上海中医药大学附属医院。

　　上海市中医医院中医药科研工作以临床实践为基础，以现代科技为手段，不断提高科研水平。积极组织2009年度各级各类课题的申报工作，目前已有41项科研课题立项（其中国家级1项、省部级5项、局级8项、校级27项），共获上级部门资助经费214.6万元。目前在研局级以上课题55项，在研院级课题73项，2009年完成课题26项。
　　全院在职职工中有全国名老中医和上海市名中医2人，享受国务院津贴15人，具有正副高级职称136人，其中新增博士后合作导师1人，博士生导师4人，硕士生导师56人，博士点3个、硕士点10个，博士后流动站1个，全院医师中硕、博士占50%以上。

　　中医药因其具有“简、廉、便、验”的特点，深受群众欢迎。我院作为三级甲等综合性中医医院积极推进“中医进社区”工作，与宝山、临汾等八家社区服务中心建立全面合作关系，在上海率先提出并施行了“双向转诊绿色通道”、“双向转诊优惠减免制度”、三级医院主任医师担任全科医师队首席医师等举措，以适宜技术推广、学术交流、人才培养等为手段，实实在在为区域民众提供优质、高效、便捷、低价的中医服务。