上海市胸科医院创建于1957年，为我国最早建立的集医疗、教学、科研为一体的，以诊治心、肺、食管、气管、纵隔疾病为主的三级甲等专科医院。1957年起被卫生部指定为全国心胸外科进修基地，1988年起成为原上海第二医科大学教学医院，1994年被评为三级甲等医院，2004年成为上海市红十字胸科医院，2005年成为上海交通大学附属胸科医院。

　　医院位于上海市徐汇区淮海西路241号，占地面积2.6万平方米。医院设有12个临床科室和10个医技科室，核定床位580张，开放床位780张，有病区17个，另设ICU,CCU。附设上海市胸部肿瘤研究所、心血管研究室和国家药物临床试验机构。现有职工1000余名，其中正副主任医师130余名、博士生导师、硕士生导师46名、享受国务院特殊津贴30余名。

　　医院面向全国，每年收治的门急诊和住院病人逾47万人次，建院以来已施行各类胸部手术近11万例，年心胸手术超过7300例、心脏介入逾2万例，成功地医治和抢救了数以万计的疑难重危病人。目前医院开展的单肺、双肺、肺叶移植术，冠心搭桥术，心脏单、双瓣膜置换术及瓣膜成形术，各种心脏复杂畸形的诊治，各类肺、食管、气管、纵隔手术，心胸外科微创手术、包括达芬奇机器人手术系统辅助下的心胸手术，各类心脏疾病的介入诊治，恶性心律失常和急性心肌梗塞的救治，气管镜的诊疗技术以及病理细胞、组织学检测等均居国内先进水平，射频消融治疗房颤的手术数量和质量为亚太地区之首，肺癌的早期诊断和多学科治疗等居国际先进水平，还曾成功施行同种异体原位心脏移植术。

　　目前医院正承担着国家重点学科“心血管病学”、国家临床重点专科“心血管内科”、“胸外科”和“心脏大血管外科”、国家中医药管理局“十二五”重点专科--中西医结合肿瘤专业、上海市肺部肿瘤学临床医学中心及上海市医学重点学科“胸外科”、上海交通大学重点学科“呼吸内科”以及上海交通大学房颤诊治中心、上海交通大学食管疾病诊治中心、上海市中医达标科室的建设；并承担着国家“十一五”、“863”攻关课题、上海市“登山计划”等多项国家、部、市、局级重大课题的研究。